m6a RNA科研设计、数据分析、结果解读 精品培训班 实操环节
m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是mRNA上最常见的化学修饰。它是一种动态可逆的化学修饰,在甲基转移酶复合物催化下产生,被RNA结合蛋白识别,可由去甲基化酶移除。m6A所涉及的生物学功能非常广泛,包括调控mRNA的可变剪接、出核、定位、翻译和稳定性等,广泛参与哺乳动物的昼夜节律、生殖发育、免疫、干细胞分化、肿瘤生成和转移以及肥胖等重要生命过程。此外,m6A也具有极强的物种保守性,迄今为止在酵母、果蝇、疟原虫、植物、高等动物中都有发现,所以作为表观遗传界的新星m6A研究将助力生命科学研究走上新台阶。
本次上机主要练习m6a测序数据(MeRIP)的分析与解读
##一、检查测序数据质量(验货一定要仔细) [《=== 文件 ===》](/resource/hugo/resource/m6a/html_home/m6a_training - part1-2.html) ##二、去除数据中的不良序列 (一把剪刀走江湖) [《=== 文件 ===》](/resource/hugo/resource/m6a/html_home/m6a_training - part1-2.html) ##三、开始比对测序数据,回帖基因组 (reads要回家) [《=== 文件 ===》](/resource/hugo/resource/m6a/html_home/m6a_training - part3.html) ##四、Post alignment QC (你以为壳子好的快递,里面也是好的嘛?) [《=== 文件 ===》](/resource/hugo/resource/m6a/html_home/m6a_training - part4.html) ##五、Sample QC (发错货这事,有时挺常见的) [《=== 文件 ===》](/resource/hugo/resource/m6a/html_home/m6a_training - part5-6.html) ##六、reads distribution (m6a在基因上的分布——另一种QC) [《=== 文件 ===》](/resource/hugo/resource/m6a/html_home/m6a_training - part5-6.html) ##七、call peak !(花这么多钱,就为了这个东西!m6a到底富集在哪?我要坐标!) [《=== 文件 ===》](/resource/hugo/resource/m6a/html_home/m6a_training - part7.html) ##八、motif(下游验证的突破口) [《=== 文件 ===》](/resource/hugo/resource/m6a/html_home/m6a_training - part8.html) ##九、功能性分析(生物学意义不能少,editor拒稿几大套路之一) [《=== 文件 ===》](/resource/hugo/resource/m6a/html_home/m6a_training - part9.html) ##十、差异分析(五指兄弟不同长,天地万物终有别) [《=== 文件 ===》](/resource/hugo/resource/m6a/html_home/m6a_training - part10.html)