江赐忠教授课题组多年来从事基因组学、基因转录调控、和表观遗传基因调控机制的研究。研究内容包括基因家族的起源进化及功能分析、与癌症关联的基因调控网络、人类突变图谱的绘制、哺乳动物CpG岛的演化分析、酵母和果蝇全基因组核小体图谱的绘制等。近年来所取得的研究成果包括:鉴定、测序和注释了200多个Myb基因,并存入NCBI数据库作为共享资源;收集整合了哺乳动物中(人、小鼠、大鼠)36个与癌症关联的转录因子家族的成员蛋白因子,并鉴定到这些蛋白因子的共11660个目标基因,识别和标注出这些基因的启动子,以此为基础,构建与癌症关联的基因调控网络,成为癌症研究中的重要资源;通过单核苷酸多态性分析,证实哺乳动物CpG岛的丢失是由于新的DNA甲基化从岛的边缘开始,慢慢向岛中央“腐蚀”造成的。这一CpG岛丢失机制的证实将极大促进我们对癌症中DNA甲基化这一表观遗传学现象的了解,为设计和研发脱甲基化药物重新激活被沉默的基因作为治疗与DNA甲基化关联的癌症的一个手段打下基础。近年来利用染色质免疫沉淀结合高通量测序技术,首次在酵母和果蝇中绘制出高分辨率全基因组核小体图谱,并分析核小体定位对基因转录的调控机制等。设计开发了预测、分析核小体及其它蛋白的DNA结合ChIP-seq数据的软件GeneTrack。

    江赐忠教授的研究结果发表在Nature、Nat Rev Genet、Genome Research等国际著名学术刊物上,共发表20篇学术论文,并撰写专业书的一个章节。以第一作者发表的论文总影响因子超过103,以非第一作者发表的论文总影响因子超过59。其中,果蝇核小体图谱绘制与基因调控方面的研究成果以Article形式于2008年发表在Nature上,目前单篇引用已超过252次。同年在Genome Research上发表的关于酵母核小体与基因调控方面的研究报道,已被引用211次。2009年在Nature Reviews Genetics上发表了一篇关于核小体定位和基因调控的综述文章(作为该期封面文章),已被引用223次。2009年10月在Genome Biology上发表的酵母核小体系统参考图被评为“highly accessed”的文章。值得一提的是,发表在Nature和Genome Research上的两篇文章同时被国际著名学术期刊Nature Methods以“Research Highlights”形式进行报道;发表在Nature Reviews Genetics上的文章被国际著名学术期刊Nature Reviews Genetics以“Research Highlights”形式进行报道。

    目前实验室主要通过高通量手段(ChIP-seq, RNA-seq等)研究以核小体重塑、组蛋白修饰为代表的表观遗传因子在胚胎发育(以果蝇为材料)、干细胞全能性维持、定向分化、与肿瘤发生发展中的表观遗传基因调控机制。欢迎有志于生命医学研究的人加盟我们的课题组。   

    通讯地址: 上海市四平路1239号同济大学生命科学与技术学院(200092)   
    电话: 021-65981193
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